江南大学研究生院（官网：gs.jiangnan.edu.cn）建有博士后流动站6个，食品科学与工程、轻工技术与工程、纺织科学与工程、控制科学与工程、化学工程与技术、设计学、环境科学与工程等7个博士学位授权一级学科，28个硕士学位授权一级学科以及6个硕士专业学位授权类别，江南大学研究生院共有博硕士研究生8169人。
学校建有江南大学宿迁产业技术研究院、江南大学（扬州）食品生物技术研究所、江南大学无锡创新设计研究院等校地联合研究院/所7个，食品科学与技术国家重点实验室、粮食发酵工艺与技术国家工程实验室、国家功能食品工程技术研究中心等国家级科研平台8个。
